蛋白质组学分析能找出癌症的潜在药物靶点
美国贝勒医学院研究人员近日在期刊Oncogene上报告,他们分析了大约800种肿瘤的数万种蛋白质数据,包括7种不同的癌症类型——乳腺癌、结肠癌、肺癌、肾癌、卵巢癌、子宫癌和儿童胶质瘤。这些数据是临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)基于质谱的蛋白质组学数据提供的。”
分析结果显示,肿瘤表现出细胞通路的改变,这些通路可能是恶性肿瘤行为的驱动因素,并可能代表新的治疗靶点。每种癌症类型在其侵袭性形式中都表现出独特的蛋白质组学特征。有趣的是,有些特征在不同类型的癌症中是共同的。
在数百个最初的候选基因中,研究人员选择了四种激酶用于子宫癌细胞系的功能研究。他们发现,这些激酶不仅在子宫癌细胞系中表达,而且还操控其他一些激酶。那些激酶有抑癌功能,能降低子宫癌细胞的存活率或抑制转移。
以往,研究人员只产生转录组的数据。观察CPTAC提供的蛋白质数据,能使研究人员能够提取出新的信息,”研究人员指出:“在这项研究中,我们比较了mRNA和蛋白质的信号,尽管在很多情况下它们是重叠的,但在蛋白质组学信号中大约有一半的蛋白质没有包含在相应的mRNA信号中,这表明在癌症研究中需要同时包含mRNA和蛋白质数据。”
资讯出处:Proteomics analysis identifies potential drug targets for aggressive human cancers. EurekAlert.
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