邵志敏教授团队成功绘制中国乳腺癌人群“基因突变图谱”
来源/视觉中国
新民晚报讯(记者 施捷)瞄准参与人体调控乳腺癌转化和耐药的敏感信号通路——PI3K/AKT通路,著名乳腺外科专家邵志敏教授团队成功地找到了哪些基因、哪些突变位点是直接导致患者预后变差的关键因素,并首次绘制出PI3K/AKT通路在中国乳腺癌人群中的基因突变谱,进而对其中的“功能性突变”进行了系统化地解读与鉴定。
这项历时5年的探索研究,被认为将为后续开展药物研发、临床试验提供更多数据和证据支持,对进一步实施乳腺癌“精准治疗”具有重要的临床转化应用价值。相关研究成果已于今天凌晨在权威的科学杂志《自然·通讯》上在线发表。
由复旦大学附属肿瘤医院乳腺外科主任兼复旦大学肿瘤研究所所长邵志敏教授、胡欣副教授领衔的研究团队与陈力及杨柳博士等,基于在肿瘤医院接受乳腺癌手术的样本,针对这一“敏感”信号通路上的PIK3CA、PIK3R1、PTEN、 AKT等七个基因的突变进行基因外显子组测序。经测序后发现,突变频率最高的是PIK3CA,占比达到44%;PIK3R1基因的突变频率为17%;这两个基因同时存在突变的情况占到了9%。
在此基础上对比美国肿瘤和癌症基因图谱(TCGA)以及肿瘤体细胞突变目录数据库,研究团队发现,中国乳腺癌患者中PIK3CA突变频率与西方数据库相当,而PIK3R1基因突变频率明显高于西方人群。研究团队首次绘制出中国乳腺癌人群该通路的基因突变谱,不仅展现了中国乳腺癌患者的基因突变特征,还首次公布了一批中国患者特有的新发现突变。
邵志敏教授解释说,经过多年的不断努力,我国乳腺癌患者术后的总体5年生存率有大幅提升。然而另一个同样值得关注的事实是,终究有30-35%的乳腺癌患者之后还是不可避免地会发生复发或转移,有患者的复发转移甚至出现在获得有效治疗的二三十年后。“我们尝试从问题的根源入手,希望梳理出在这条对乳腺癌内分泌治疗、化疗最重要的人体信号通道上那些活跃着的基因突变,并进一步区分出哪些突变会导致乳腺细胞的癌变乃至耐药。”
为进一步弄清楚PIK3CA和PIK3R1基因中哪些位置上的突变将导致乳腺细胞癌变和耐药情况产生,研究团队还自主研发了一套名为ReMB功能性突变筛选系统,并针对两个基因的大部分突变点位进行系统化的功能性研究和鉴定,最终确认:在PIK3CA基因中的第39、1049、345、1043、1047等点位发生的突变,在PIK3R1基因中的第160、329、560等点位发生的突变,都将导致乳腺细胞的恶性转化以及化疗药物表阿霉素和通路抑制剂BKM120的耐药。
“通过这项研究,我们将能够成功地预测导致乳腺肿瘤细胞快速增殖和耐药的‘坏分子’。”邵志敏表示,他非常看好这一具有极强临床转化应用价值的研究,随着相关研究的继续推进,期待它能突破现有乳腺癌诊疗过程中的“瓶颈”和难点,给患者带去生存获益。