美国全基因测序新突破将为晚期癌症患者带来什么？

徐红虹，Arul Chinnaiyan和Dan Robinson。来源：密歇根大学综合癌症中心

一项新的研究发现，转移性癌症比早期肿瘤中具有更多的基因突变。

这意味着：要使精准医学在癌症护理中成为现实，需要一种实时、全面的方法，大多数商业检测公司无法将转移性肿瘤和序列的细节检出。

密歇根大学综合癌症中心的研究人员正在进行检查晚期癌症遗传和分子学蓝图的最大最全面的努力之一中，目前已经对500名转移性癌症患者的DNA和RNA进行了测序。结果发表在nature。

三个突破使这一分析是全球独一无二的！！！

研究人员为大多数患者从转移性肿瘤中获得新鲜活检，提取样本，而不是原发性肿瘤。

他们对DNA和RNA分别进行了测序。

他们将癌组织与患者的正常组织DNA进行比较。

密歇根病理转化中心主任，高级研究人员Arul Chinnaiyan博士说，“这是一种比大多数商业检测机构更全面的方法，我们的结果在多个层面上表明有更高的价值。”

数据来自500名实体瘤患者参加密歇根肿瘤学测序计划，这是2010年开始的一项研究方案，对转移性癌症和正常组织的DNA和RNA进行测序，以确定可能有助于推动治疗的改变。该计划包括精神治疗肿瘤委员会，专家讨论每个病例。Mi-ONCOSEQ是为癌症患者提供的首个综合临床测序项目之一。

“自然”杂志上刊登的病例涵盖了超过30种类型的癌症，转移到22个不同的器官中。它只包括具有实体瘤的成年人，尽管Mi-ONCOSEQ可用于血液癌症和儿童肿瘤患者。

活检转移病灶，而非原发病灶

研究人员发现患者转移性癌症与原发性癌症之间相比，突变的数量和类型有显着增加。他们发现几乎每一例转移性癌症都有更多的突变。这可能反映出转移性癌症更具侵略性：他们将用更多的时间研究更多的突变，旨在杀死引起更多的突变的癌症的治疗方法。

“我们的研究结果强调了对转移性肿瘤的新鲜活检的重要性，”Chinnaiyan说。“肿瘤在治疗后转移的部分会发生进化，我们需要对转移性肿瘤进行活检，然后提出治疗方法，而不是使用原发性肿瘤的存档组织。

RNA测序揭示更多的靶标

另一个关键因素是对RNA以及DNA都进行测序。这种更广泛的方法揭示了许多在肿瘤微环境中发挥作用促进和允许癌症继续生长，扩散或逃避治疗的分子因子。

通常，大多数临床测序工作仅关注于DNA测序。虽然DNA测序也能揭示涉及转移性癌症的遗传改变，但研究人员发现RNA测序能够指出可能导致致癌基因，或关闭旨在阻止癌症基因的基础机制。他们的发现可以帮助确定潜在的治疗目标。

此外，通过观察RNA，研究人员可以检查肿瘤微环境中的免疫细胞，这提供了为什么免疫治疗可能适用于一些患者但不适用于其他患者的线索。

“了解免疫微环境 -浸润肿瘤细胞类型及其表达的重要性，这给我们提供了免疫表型的图片，我们的假设是，我们可以用它来帮助确定谁可能对免疫治疗有效“，

Chinnaiyan说，注意到这方面需要更多的研究。

另一个关键发现是转移性肿瘤显示出两个相互排斥的特性。一个是高度增殖，意味着它积极地增长。另一方面，细胞失去分化，称为上皮至间质转化的状态。

Chinnaiyan说：“并不是所有的转移都是一样的，不同的途径下的转移是完全不同的 -这是一个引人注目的发现，可以指导我们开发新型的治疗方法。

遗传突变发现

另一个引人注目的发现是，12％的转移性癌症患者存在遗传突变。这大概是所有癌症患者预期的四倍。通过比较肿瘤DNA与正常DNA可鉴定出这些突变。

这些突变中有四分之三与DNA修复过程有关。

Chinnaiyan说：“在转移性癌症中遗传突变的百分比很高，一旦发现这些突变，家族中其他的可能也可能携带该基因并且患有更高的癌症风险。

如果适当，家庭成员可以寻求遗传咨询或增加筛选。 Mi-ONCOSEQ患者接受遗传咨询，在遗传性突变的情况下也延伸到家属。

研究人员正在分析来自该初始组的患者预后。今年早些时候在美国临床肿瘤学会年会上提出的初步数据表明，四分之三的患者肿瘤测序显示至少有一个“可操作的突变”，意味着存在针对这种特异性差异的治疗方法。迄今为止，已有近2,300名患者参加了Mi-ONCOSEQ。

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