权力在手的田令孜更加骄横，对皇帝也敢禁制
权力在手的田令孜更加骄横，对皇帝也敢禁制
中和三年（公元883年），在唐军的联合进攻下，黄巢溃败，逃出长安。田令孜却把打败黄巢，收复长安的功劳记在宦官的头上，说是宦官杨复光请沙陀首领李克用进军长安，京师才得以收复；而担任诸道行营都统的中书令王铎，却讨伐黄巢久战无功。因此，将王铎贬为义成节度使，副都统崔安潜贬为东锦留守。
田令孜又害怕杨复光功劳太大，对自己构成威胁，故意减少对杨复光的奖赏。夸大自己的功劳，说自己首先建议皇帝幸蜀避难；并悉心保护传国玉玺及唐朝历代帝王的真容；又散家财犒劳将士；正是自己的运筹帷幄，对保卫大唐起了决定性的作用。并指使宰相、藩镇为自己请功加赏，唐僖宗遂任命田令孜为左右神策军十军兼十二卫观军容使。
与此同时，田令孜还竭力培植党羽，对王建（即后来的前蜀开国皇帝）等五人赏赐巨万，并收为养子。又让他们各统一军，号称“随驾五都”。
权力在手的田令孜更加骄横，居然对皇帝也敢禁制。唐僖宗不能有自己的主断，事事必须听从“阿父”的指示。唐僖宗终于认识到这个“阿父”田令孜越来越专权，自己只不过是个傀儡而已。
光启元年（公元885年），唐僖宗回到长安。黄巢之乱虽然平定了，但后果却是很严重的。王朝的统治秩序被彻底打乱了，藩镇割据的局面已经在战争中形成。藩镇备专租税，不再向朝廷上供，朝廷只能依据京畿、同、华、风翔等数州的租税来供应财政支出。但从成都迁回的却是一整套政府机构，仅宦官与朝宫就有一万多人；田令孜在成都时，招募新军五十四都，每都一千人；还有王建等五人的“随驾五都”。庞大的国家机器与其财政收入发生了严重的矛盾。由于赏赐减少，引起了士卒的不满。田令孜害怕军队叛乱，只好割夺藩镇的利益来解决矛盾，结果激起藩镇与朝廷的严重冲突。
河中节度使（今山西境内）王重荣，独占境内安邑、解县两盐池之利，每年只献盐三十车以供国用。田令孜启奏唐僖宗将两盐池收归国有，并自兼榷盐使，以所得利润供应军队开支。王重荣不愿意交出盐池，遂上书抗辩。田令孜改调王重荣为泰宁节度使。玉重荣认为自己对收复京城有功，却被田令孜排斥，数次上表，说田令孜离间君臣关系，并列数田令孜十大罪状。田令孜勾结邠宁节度使朱玫与凤翔节度使李昌符一起对付王重荣。并派遣神策军与朱玫、李昌符部等诸镇军队，屯集沙苑（今陕西大荔南），讨伐王重荣。
王重荣向李克用求救，王、李两军汇合后，上表唐僖宗请诛死田令孜、朱玫、李昌符。皇帝“和稀泥”，没有同意。双方会战，朱玫、李昌符败归本镇。溃败散兵到处焚烧房屋，抢掠财物。李克用率军进逼长安，田令孜挟唐僖宗等连夜从开远门逃往凤翔。
诸道兵进入长安后，大肆焚挠抢掠，长安城里的宫室以及民居被烧毁十之六七，长安城在被黄巢焚烧后，又一次遭到了更为严重的破坏。李克用回到河东，与王重荣又一次上表请求唐僖宗回宫，并指证田令孜的罪状，要求处死田令孜。唐僖宗只得重新起用杨复恭（杨复光之弟，曾被田令孜排斥）为枢密使。此时的田令孜，已失去了唐僖宗的信任。
田令孜想继续控制唐僖宗，作为保护自己的屏障，因此要唐僖宗逃往兴元，唐僖宗不再听从田令孜，拒绝到兴元。夜里，田令孜率兵冲入行宫，劫持唐僖宗逃往宝鸡。朱玫和李昌符此时见田令孜已经势衰力孤，且又害怕李克用与王重荣，因此改附李克用。
大部分朝官都憎恨田令孜，不愿去宝鸡，要夺唐僖宗回城。朱玫、李昌符率兵进攻宝鸡，田令孜又带着唐僖宗逃往汉中。光启二年（公元886年）四月，朱玫、李昌符将因病没有跑掉的襄王李煴，挟持到长安立为傀儡皇帝，改元“建贞”。唐僖宗则被尊为“太上元皇圣帝”。后来，朱玫被杀，李煴事变平息，不少官员却惨遭杀戮。此时，失势的田令孜知道自己已不为天下所容，只好让位给杨复恭，自任西川监军使，到成都去投靠其兄陈敬瑄。
文德元年（公元888年）三月，唐僖宗死。杨复恭立寿王李晔为帝，即唐昭宗。杨复恭代替了田令孜担任观军容使，把田令孜的干儿子王建调出为壁州刺史。可王建夺取了利州，自命为防御使。接着又攻占了阆、邛、蜀、黎、雅等州。新皇帝无法阻止，只好诏令在这些地方设置永平军，任命王建为节度使。
田令孜打算与王建联合对抗朝廷，便写信召他来。王建很乐意干这样的事，可是将要去的时候，田令孜却拒绝了他。王建对此颇为愤怒，率兵包围了成都。田令孜登上城墙向王建道歉，并问他为什么把城围困住。王建说，只要义父改变与朝廷对抗的打算，那么，父子之间仍然可以像当初一样相处。田令孜要求和王建面谈，王建也答应了。当晚，田令孜带着印信符节来到王建的军营。次日，王建进入成都，却把田令孜和陈敬瑄关禁在了碧鸡坊。两年后，田令孜和陈敬瑄在同一天被处死。临刑时，田令孜把丝绢撕成条，结成绳索，交给行刑的人说：“我曾担任十军观军容使，杀我也罢，但还是有一定规矩的。”于是，教行刑者用绳索勒死人的方法。《新唐书》这样记载：“临刑，裂帛为絙，授行刑者曰：‘吾尝位十军容，杀我庸有礼！’因教缢人法，既死，而色不变。”一个专权而失势的大宦官，就这样死在了自己扶植起来的干儿子手里。死到临头，也还算是脸不变色，至于心跳不跳就不知道了。儿子杀老子，这也算是“以毒攻毒”吧！
对这样一个曾经权倾天下的大宦官，逸史《出玉堂闲语》就记载了这样一段轶事：长安城的西市有一家卖汤药的店铺，用的都是几味平常药。当病人来买药时，既不管病人的药方和脉象，也不问病人得的是什么病，反正一百文钱一付药。说来也怪，不论你得的是什么疾病，服下汤药就好。因此，这家店铺常年在宽敞的宅院中，安装了特制的大锅，不分白天黑夜地锉、砍、煎、煮，提供汤药，没有一点空闲。人们不管远近，都纷纷前来买药，店铺门前的拥挤喧闹之声响遍长安城，以至这家人要花钱雇人来看守门户。来买药的人，有的等了六、七天，还未必能买到药。当时，田令孜病了，海内的医生都让他看遍了，包括宫中的御医和待命服务朝廷的医师，全都诊断不出他到底得了什么病。一日，他的亲信告诉他说："西市有一家卖汤药的店铺，在长安很有名气，不妨试一下。"田令孜说："可以。"于是派仆人骑马前去取药。仆人拿到药，立即策马回来，快要到牌坊附近的时候，因为马受惊，颠簸不停，药全撒了。仆人因为惧怕主人，知道空手回去无法交待，但按药房的规矩，又不能再去重取。于是，仆人来到一染坊，经乞求，得到了一钵染料的残液，仆人立马拿回去交差了事。奇怪的是，田令孜服下染料残液后，怪病居然治好了。田令孜只知道自己的病好了，却不知道“药”是从哪儿来的，便厚赏了卖汤药的店铺。这家卖汤药的店铺身价比以前更高了，这家店也由此积贮的财物越来越多。这简直就是“福医”呵！正因为有了名气，汤药店后来被一番王带到了塞外，由内销变成出口外销了。
看来，一个品行不端，被世人唾弃的人，人们是会想方设法编排讥讽他的。田令孜吃染料残液治好了病，大概就是嘲讽田令孜“以毒攻毒”的意思吧！