重磅，IBM 将三个抗癌 AI 项目开源

开源最前线（ID：OpenSourceTop） 编译
项目地址：https://www.techzine.be/nieuws/41092/ibm-maakt-drie-ai-projecten-gericht-op-kankeronderzoek-opensource.html

近日，IBM向开源社区发布了三个旨在克服治愈癌症的AI项目。在本月晚些时候将在瑞士举行的第18届欧洲计算生物学大会（ECCB）和第27届分子生物学智能系统大会（ISMB）上，将会深入介绍PaccMann项目。

2018年，癌症导致全球960万人死亡，此外，同年增加了1800多万新的癌症病例。IBM计算系统生物学小组的研究人员已经开始研究基于AI和机器学习的方法，通过它们帮助我们快速了解这些诱导这些癌症的主要因素和分子机制，除此之外，重点还在于提高对肿瘤的构成认知。

通过遗传，污染，吸烟和饮食方面的倾向都被认为是引发癌症的可能性因素，但仍然还有许多需要去探索的因素，IBM表示：我们的目标是加深对癌症的理解，以便有朝一日我们能够为行业和学术界提供新的治疗方向或知识。

此次IBM开源的三个项目如下：

1、PaccMann

PaccMann项目旨在利用基于注意力的多模式神经网络来预测抗癌化合物的敏感性，ML算法自动分析化合物并预测最有可能对抗癌症菌株的化合物。

该算法使用基因表达数据和化合物的分子结构。IBM表示，早期识别潜在的抗癌化合物可能会降低药物开发的成本。目前开发单一药物治疗癌症就需花费数百万美元，正是因为这高昂的研发成本阻碍了我们开发新药物和疗法的步伐。（地址：https://www.zurich.ibm.com/paccmann/）

2、INtERAcT

INtERAcT能够帮助研究人员从大量的科学文献中自动提取有价值的数据。每年在癌症研究领域出版约17,000种出版物，研究人员做不到一一阅读这些内容，INtERAcT目前正在测试提取与蛋白质 - 蛋白质相互作用的相关数据，该研究领域，已被确定为包括癌症在内的多种疾病中生物过程中断的可能因素。（地址：https://www.zurich.ibm.com/interact/）

3、PIMKL

第三个项目PIMKL是一种使用数据集的算法，该算法利用描述我们目前在分子相互作用方面的数据集，以此来预测癌症的进展和患者复发的可能，这是多核学习的一种，可以识别分子路径，这对于患者分类至关重要，可以为医疗保健专业人士提供个性化和调整治疗计划的方案。（地址：https://www.zurich.ibm.com/pimkl/）

以上这三个项目都已经开源，PaccMann和INtERAcT的开源代码可以在各自的官网中找到，PIMKL已部署在IBM云上，源代码也已发布。