厉害了脑脊液检测技术,准确识别肺癌脑转移瘤突变特征不再难!
脑脊液检测灵敏度低至0.1%,癌症早筛前景可期!
来源丨医学界肿瘤频道
刚刚结束的第十五届中国肺癌高峰论坛(中国临床肿瘤学会、中国抗癌协会肺癌专业委员会主办),聚焦在肺癌临床前沿话题之一:中枢神经系统转移:精准诊断,精准治疗。
泛生子首席科学家阎海教授发表主题演讲
在阎海教授《揭示深藏在脑部肿瘤中的基因突变与病理机制》的主题演讲中,总结了泛生子在过去4年多时间里积累的近万例脑部肿瘤及肺癌脑转移检测结果以及最新的科研成就,展望了现代科学技术,尤其是基因组学研究在肺癌脑转移诊断、治疗领域的潜在临床价值。
本文以文字版总结了其中重要内容,以飨读者。想看阎海教授完整主题演讲视频,可在文末戳阅读原文哦。
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肺癌脑转移诊疗困难重重
20%-65%的肺癌患者在病程中会发生脑转移。导致肺部肿瘤倾向发生脑转移的可能机制包括:肿瘤本身的基因背景、血脑屏障、肿瘤免疫微环境、氧气、代谢、免疫识别等,其中异常紧密的血脑屏障的存在,导致外周血中很难发现肺癌脑转移的肿瘤细胞及其遗传信息。
通过横向对比原发脑胶质瘤和继发肺癌脑转移瘤的基因特征、代谢途径、细胞起源等,可提示不同脑部肿瘤的分子特性及临床诊疗策略。泛生子凭借继往在胶质瘤诊疗领域的权威学术积累和临床转化成果,将加速推动临床肺癌脑转移科学机制的探索与应用转化。
肺癌脑转移临床诊治的困难之一,在于转移灶的异质性非常明显,这是由于血脑屏障的存在,进入脑部的肿瘤细胞仅为极个别“投机分子”,由于随机突变的发生和累积,以及转移微环境的选择和适应,使得脑部转移灶形成了不同于肺部原发灶的独特的分子背景,即所谓的“肿瘤异质性”。
此次肺癌脑转移的临床诊治共识认为,必须同时了解肺部原发灶和脑转移灶的基因背景,来克服”肿瘤异质性”导致的用药选择偏差。
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脑脊液检测强势登场,临床应用优势显著
如何有效获取脑部转移灶的肿瘤信息?泛生子通过大量的临床样本测试,证实脑脊液样本突变丰度相较于外周血,明显更接近组织样本,可更有效的反映脑部转移瘤的突变特征。
泛生子研发团队取经国际顶级研究成果,对脑脊液上清提取的CSF cfDNA和脑脊液细胞沉淀提取的CSF pellet DNA进行了对比检测,发现CSF cfDNA中不同基因检出的变异频率明显高于CSF pellet DNA,在拷贝数变异检出数目和基因的变异倍数(HER2基因)方面CSF cfDNA也具有显著优势。
同时结合泛生子自主研发的超高深度数字测序技术(Ultra-deepDigital Sequencing, UDD-Seq),通过独特身份标记接头(双Barcode)在20000X测序深度下,可达到0.1%的检测灵敏度,并利用专有生物信息去重算法,超高保真还原样本原始片段,杜绝假阳性的检出,保证脑脊液液态活检产品的特异性。
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分子诊断是大势所趋
在2008到2009年期间,阎海教授及其团队首次发现IDH1/2为胶质瘤中最为常见的与代谢改变相关的基因变异,而泛生子接下来将要深入探索的科学问题,是不具有该种变异的肺癌细胞如何适应脑部代谢和免疫微环境。
同时,基因组学在脑肿瘤的肺转移中,泛生子亦曾通过脑脊液检测,为患者更好的指导了诊断及用药,延长了生存期。通过脑脊液这种无创检测手段,我们可对肺癌脑转移病人进行分子分型、指导其用药,并进行监测,且可使用这一手段有效帮助相关药物的研发,将基因组学广泛应用于癌症的诊断以及治疗领域,切实帮助到临床。
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癌症早筛前景无限,未来可期
在早筛领域,分子手段的应用亦已有突破性进展,阎海教授的导师——来自约翰霍普金斯医学院著名教授Bert Vogelstein博士及其团队,已开发了基于游离DNA和蛋白定量的组合性方法用于早期癌症的发现,并实现精准定位。
相信在不远的将来,这一技术能够对人类多种癌症的早期诊断做出显著贡献,从而真正实现早期干预,在早期就杜绝癌症的发生。未来,泛生子会继续与以Bert教授为代表的国内外最顶级的科学家和科研机构紧密合作、共同探索,并携手临床专家共同推进癌症早筛研究成果的快速转化,从而共同完成人类战胜癌症的光荣使命。
在媒体专访环节,阎海教授就行业热点话题分享了自己的见解。
问:肺癌脑转移的机制和原因方面有哪些新的进展?对临床的价值是什么?
阎海:“肺癌脑转移”是今天大会的重要主题。肺癌容易发生脑转移,但脑瘤很少会转移到肺,这个差异和肿瘤特异的微环境有关系。所以要弄清转移发生的机制还要对整个脑部生理和病理学有所了解。
肺部原发肿瘤和其转移瘤在基因突变上有很大区别,所以必须对转移后的肿瘤进行检测,了解其特有的分子变化,对肿瘤进行靶向治疗。我们和其他同事的前期工作表明,脑脊液液态活检是一种十分有效的检测手段,可以发现脑转移瘤的基因突变, 从而指导临床治疗。
但未来我们还是应该在肺癌的早期发现上研发出更加特异灵敏的方法,早期发现是肺癌治疗最为有效的方案。
问:脑部肿瘤近些年来您认为最重要的研究进展有哪些?
阎海:脑部肿瘤是恶性程度非常高的肿瘤,比如胶质瘤,生存情况并不理想。随着对胶质瘤发生发展的分子机制和肿瘤分型了解的深入,最近几年胶质瘤的诊断治疗有了很大的突破,现在可以利用基因检测技术对胶质瘤进行精确的分型,从而对病人预后作出准确判断,精准指导临床实验与治疗。
此外,胶质瘤的免疫治疗也取得了重大的突破,这些都为胶质瘤患者生存时间和质量的提高带来很大的益处。
问:NGS在脑肿瘤诊疗中的价值是什么?
阎海:长久以来,病理医生通过在显微镜下观察肿瘤的细胞学形态,判断胶质瘤的良恶性。但肉眼看到的并不能反映肿瘤特殊的分子机制,而分子机制恰恰是决定肿瘤发生发展、恶性程度、生物学和病理变化最重要的因素。
如今二代测序技术(NGS)能够清晰的把肿瘤内部基因的变化展示给医生和患者,指导治疗。相比一代测序,NGS保持了较高的准确性,且具有更加全面、更加高效、更低成本的优点。
2017年FDA批准了FoundationMedicine的NGS panel 检测方法,用来指导临床的精准治疗,针对特定的靶点或特殊基因变化情况给予靶向或免疫治疗。
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