LncRNA(长链非编码RNA)测序

长链非编码RNAs(long non-coding RNAs, lncRNAs)是一类长度超过200nt的RNA，且不参与编码蛋白质功能（不含rRNA），广泛分布于各种生物体内。lncRNAs参与表观遗传、转录以及转录后等多个水平的调控过程，在生命机体活动中起到重要的作用。lncRNAs测序是运用高通量测序技术结合先进的生物信息学分析，可以一次性获得样本中几乎全部的lncRNAs信息，为您全面、深入地研究lncRNAs的功能提供了全新的工具与策略。

技术路线：

技术参数：

技术优势：

1、性价比高：最少量的样品，一次测序可得到数百万条序列，单次运行可经济分析多个样品；

2、技术稳定，建库重复性好：同一样本重复建库相关性P值大于0.993；

3、数据量产出大：基于高通量测序技术，可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA信息，有利于提高后续分析结果的准确性和全面性；

4、分析结果全面：不局限于对已知lncRNA的研究，还可预测和研究潜在的lncRNA分子；

5、灵敏度高：数字化信号，灵敏度高，可以准确检测到痕量表达的lncRNA；

6、除人和鼠外，还可应用于其他真核物种，可共同制定定制化研究方案。

样品要求：

样品类型：总RNA；

样品浓度：≥200 ng/ul；

样品总量：≥15ug；单次文库制备用量分别为5ug，为保证实验的顺利进行，因此需保证样品总量大于3次以上的建库用量（不包括样品检测损耗）；

样品纯度：OD260/280为1.8~2.2，OD260/230≥1.0，260nm处有正常峰值；无基因组DNA污染；

RNA完整性：电泳检测28S/18S≥1.5。（据送样日最近的电泳结果）

成功案例：

采用RNA-seq测序技术，对14个中国前列腺癌病人的转录组进行全面分析，结果在每个样本中平均发现了1599个已知的lncRNA。通过肿瘤样本和正常样本进行分析，发现了406个有差异表达的lncRNA。该研究找到了中国人群特异的融合基因，同时还鉴定了大量的差异表达的lncRNA。通过对lncRNA和基因表达的关系分析显示，lncRNA有可能有转录调控之外的其他功能。这些研究结果为进一步了解前列腺癌的诊断、发病演化机制和种族差异性提供了新的线索。

参考文献：

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[1]Lin M F, Regev A, Pauli A, et al. Systematic identification of long noncoding RNAs expressed during zebrafish embryogenesis[J]. 2013.

[2]Ren S, Peng Z, Mao J H, et al. RNA-seq analysis of prostate cancer in the Chinese population identifies recurrent gene fusions, cancer-associated long noncoding RNAs and aberrant alternative splicings[J]. Cell research, 2012, 22(5): 806-821.

[3]Pauli A, Valen E, Lin M F, et al. Systematic identification of long noncoding RNAs expressed during zebrafish embryogenesis[J]. Genome Research, 2012, 22(3): 577-591.