南加州大学 | 如何减少化疗耐药?数学大数据模型来帮忙

文 / 生命科学
2018-04-12 10:43

编译 | 干玎竹

来源 | 搜狐健康

化疗药有很强的副作用,如何在保证疗效的情况下尽量少给药?一些生长特别快速的癌症,是否应该持续输注低剂量药物,而不是定期给予高剂量冲击?据Webmed网站报道,南加州大学Paul Newton教授和他的博士Jeffrey West开发了一种工具,可以用数学模型来预测癌症患者的最佳化疗方案。该研究结果发布在《癌症研究》杂志上。

Paul Newton团队的数学模型基于进化信息的应用和细胞数据,根据肿瘤的生长速度来设计。因为研究人员可以根据他们的模型运行计算机模拟,他们不受与临床试验相关的限制。

“我们正在努力优化化疗方案,以减少那些明确由化疗带来的问题。”南加州大学克医学院诺里斯综合癌症中心的航空航天和机械工程、数学和医学系Newton教授说。

化疗方案与耐药性

他们研究的焦点之一是通过竞争而产生的化疗耐药性。

传统上,为了减少和逐步消除肿瘤,患者会被给予针对全身所有癌细胞的足量化疗计划。他们一直接受这个剂量的化疗药直到肿瘤消失。最常见的是每两到三周接受一次高剂量的化疗——也称为最大耐受剂量疗程( MTD )。但也有一种方法是通过低剂量、持续的治疗计划(低剂量疗程,LDM )。

化疗中最常见的情况是:刚用药时肿瘤缩小,好像药物起效了;随后肿瘤还会复发,尽管患者在持续接化疗。复发的原因取决于肿瘤自身的特征。

Newton指出,“每一个肿瘤中不仅仅包含一种癌细胞,而是一大堆不同种类的癌细胞,它们以不同的生长速度相互竞争。”

癌细胞耐药性产生的机理

肿瘤中三种相互竞争的细胞亚群:健康细胞、敏感细胞、和耐药性细胞。不化疗导致肿瘤生长;持续化疗一开始让肿瘤缩小,然后发生耐药,最终化疗不再有效。

在化疗药物消灭了大量、多种癌细胞后,能存活下来的都是耐药性癌细胞。存活下来耐药癌细胞已经“脱离了竞争”,生长空间和营养空前富足,所以就可以自由地生长和分裂。因此,下一轮化疗的效果要差得多。

实验是这么做的

韦斯特说:“活检或肿瘤成像时,我们无法得知肿瘤中耐药癌细胞的数量,也不能预判哪些细胞会耐药。建立数学模型的作用之一就是来预测临床上无法直接监测到的事物。"

工具使他们能够测试不同的化疗方案下肿瘤细胞群的变化。

为了做到这一点,他们使用了MTD或LDM治疗癌症的现有数据,并使用进化博弈论(一种数学框架,使用达尔文的“适者生存”概念)来模拟细胞之间的竞争。该模型随机挑选两类细胞进行面对面的竞争,根据“适应度”来确定获胜者,适应度取决于该类细胞的生长速率。

“玩家”包括健康细胞、靶向癌细胞和耐药性癌细胞。根据不同种群的细胞组成,在计算机中反复模拟竞争,对于每种治疗方案,该模型都会举办数百万次竞争,模拟肿瘤随时间推移最有可能如何发展。

Newton说:“我们循环查看所有可能的时间安排和不同药物浓度的组合,我们创建了一个柱状图,列出了在不同情况下最有可能获得的好处。”

化疗方案应该由肿瘤的生长速度来决定

研究者发现化疗方案应该由肿瘤的生长速度来决定,目前这在临床上还没有实现。例如,快速生长的肿瘤,如脑癌,使用LDM会控制得更好;而MTD对缓慢生长的肿瘤更有效,如前列腺癌。

West说:“希望未来的化疗方式是用数学方法建立患者的个体化模型,患者走进诊所后,输入他们的信息,然后运行模型,根据模型预测最佳的化疗时间表和化疗药物。”